夏越の大祓は、水の大祓として伝えられています。当日は、御神水湧き出づる水祥殿に葦船をととのえ、その中に穢れを託した形代（人形）を乗せ、古神道の伝承にしたがって、天地自然の力にまかせて海川辺に放ち、祓い清めます。また、神域では、古くから病気を免れるという茅の輪くぐりの神事も執り行います。